сгенерировать QR код
Открытый доступ
Только для подписчиков
Структурно-функциональная организация митохондриального генома карельской березы
https://doi.org/10.29235/1818-9857-2025-10-77-83
Аннотация
Представлены результаты впервые проведенного секвенирования митохондриального генома карельской березы. Длина полноразмерной молекулы мтДНК составила 581,3 тыс. н.п. Аннотировано 65 структурных генов, 36 из которых кодируют белки, 26 – тРНК и 3 – рРНК. Выявлены генетические особенности структурн-офункциональной организации митохондриальной ДНК по отношению к хлоропластному геному карельской березы и митохондриальным геномам других таксономических групп организмов. Идентифицировано 469 микросателлитных локусов для разработки панели высокоинформативных генетических маркеров.
Ключевые слова
митохондрия,
хлоропласт,
мтДНК,
хпДНК,
карельская береза,
Betula ssp.,
геномика,
высокопроизводительное секвенирование
Об авторах
П. Кирьянов
Институт леса НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Павел Кирьянов, научный сотрудник лаборатории геномных исследований и биоинформатики
С. Пантелеев
Институт леса НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Станислав Пантелеев, заведующий лабораторией геномных исследований и биоинформатики, кандидат биологических наук, доцент
Л. Можаровская
Институт леса НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Людмила Можаровская, ученый секретарь, кандидат биологических наук, доцент
О. Баранов
Отделение биологических наук НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Олег Баранов, академик-секретарь, член-корреспондент
Список литературы
1. Møller I.M. Plant mitochondria – past, present and future / I.M. Møller, A. G. Rasmusson, O. Van Aken // The Plant Journal. 2021. Vol. 108, №4. P. 912–959.
2. Даниленко Н.Г. Миры геномов органелл / Н. Г. Даниленко, О.Г. Давыденко.– Минск, 2003.
3. Zimorski V. Endosymbiotic theory for organelle origins / V. Zimorski, C. Ku, W.F. Martin, S.B. Gould // Current Opinion in Microbiology. 2014. Vol. 22 – P. 38–48.
4. Boore J.L. Animal mitochondrial genomes / J.L. Boore // Nucleic Acids Research. 1999. Vol. 27, №8. P. 1767–1780.
5. Specific role of mitochondrial electron transport in blood-stage Plasmodium falciparum / H.J. Painter, J.M. Morrisey, M.W. Mather, A.B. Vaidya // Nature. 2007. Vol. 446. P. 88–91.
6. Chromosome-Level Genome Assembly for the Angiosperm Silene conica / P.D. Fields, M.M. Weber, G. Waneka [et al.] // Genome Biology and Evolution. 2023. Vol. 15, №11. Art. №192.
7. Sloan D.B. One ring to rule them all? Genome sequencing provides new insights into the «master circle» model of plant mitochondrial DNA structure / D.B. Sloan // New Phytologist. 2013. Vol. 200, №4. P. 978–985.
8. Transfer of chloroplastgenomic DNA to mitochondrial genome occurred at least 300 MYA / D. Wang, Y.-W. Wu, A.C.-C. Shih [et al.] // Molecular Biology and Evolution. 20 07. Vol. 24, №9. P. 2040–2048.
9. The Mighty NUMT: mitochondrial DNA flexing its code in the nuclear genome / L. Xue, J.D. Moreira, K.K. Smith [et al.] // Biomolecules. 2023. Vol. 13, №5. P. 753.
10. Parakatselaki M.-E. mtDNA Heteroplasmy: origin, detection, significance, and evolutionary consequences / M.-E. Parakatselaki, E.D. Ladoukakis // Life. 2021. Vol. 11, №7. Art. №633.
11. Падутов В.Е. Методы молекулярно-генетического анализа / В.Е. Падутов, О.Ю. Баранов, Е. В. Воропаев.– Минск, 2007.
12. Structure and phylogeny of the curly birch chloroplast genome / K . A . She s tibr atov, O.Y. B ar anov, E.N. Mescherova [et al.] // Frontiers in Genetics. 2021. Vol. 12. Art. №625764.
13. Schneider A. Import of RNA into mitochondria / A. Schneider // Trends in Cell Biology. 1994. Vol. 4, №8. P. 282–286.
14. Codon recognition rules in yeast mitochondria / S.G. Bonitz, R. Berlani, G. Coruzzi [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1980. Vol. 77, №6. P. 3167–3170.
15. Secondary structure of the human mitochondrial genome affects formation of deletions / V. Shamanskiy, A.A. Mikhailova, E.O. Tretiakov [et al.] // BMC Biology. 2023. Vol. 21, №1. P. 103.
16. Hao W. Fine-scale mergers of chloroplast and mitochondrial genes create functional, transcompartmentally chimeric mitochondrial genes / W. Hao, J.D. Palmer // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2009. Vol. 106, №39. P. 16728–16733.
Рецензия
Для цитирования:
Кирьянов П., Пантелеев С., Можаровская Л., Баранов О. Структурно-функциональная организация митохондриального генома карельской березы. Наука и инновации. 2025;1(10):79-85. https://doi.org/10.29235/1818-9857-2025-10-77-83
For citation:
Kiryanov P., Panteleev S., Mozharovskaya L., Baranov O. Structural and functional organization of the Karelian birch mitochondrial genome. Science and Innovations. 2025;1(10):79-85. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1818-9857-2025-10-77-83
Просмотров:
9
Послать статью по эл. почте 