Метагеномный анализ грибных фитопатогенов посадочного материала берез
https://doi.org/10.29235/1818-9857-2022-3-66-70
Аннотация
Приведены данные о метагеномной технологии, позволяющей за один цикл устанавливать весь спектр организмов в экспериментальном образце, в то время как ранее требовалось отдельное исследование для каждого потенциально содержащегося компонента. Представлен комплексный подход как метод ранней диагностики возбудителей основных грибных заболеваний при фитопатологическом скрининге растений березы повислой (Betula pendula Roth) и березы пушистой (Betula pubescens Ehrh.), основанный на оценке размера внутренних транскрибированных спейсеров (ITS1 и ITS2) в кластере генов 18S-5.8S-28S рДНК с учетом специфичности величины спейсеров рДНК-оперона, постоянной для большинства видов микромицетов, а также возможности электрофоретического анализа ITS1- и ITS2-локусов, который позволяет проводить видовую идентификацию доминирующих видов фитопатогенных грибов березы в условиях in planta.
Ключевые слова
Об авторе
В. Падутов
Институт леса НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Владимир Падутов, заведующий научно-исследовательским отделом генетики, селекции и биотехнологии, член-корреспондент
Список литературы
1. Государственный лесной кадастр Республики Беларусь по состоянию на 01.01.2021 года. – Минск, 2021.
2. J. Bakonyi, Z. Á. Nagy, T. É. Rsek. PCR-based DNA Markers for Identifying Hybrids within Phytophthora alni // Journal of Phytopathology. 2006. Vol.154(3). P. 168–177.
3. White T.J., Bruns T.D., Lee S.B., Taylor J.W. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics // PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (M. A. Innis, D. H. Gelfand, J. J. Sninsky, T. J. White eds.). – New York, 1990.
4. J. F. Elder, B. J. Turner, Concerted evolution of repetitive DNA sequences in eukaryotes // The Quarterly Review of Biology. 1995. Vol. 70(3). P. 297–320.
5. M. Arteau, S. Labrie, D. Roy. Terminal-restriction fragment length polymorphism and automated ribosomal intergenic spacer analysis profiling of fungal communities in Camembert cheese // International Dairy Journal. 2010. Vol.20(8). P. 545–554.
6. C. Callon, C. Delbès, F. Duthoit, M. C. Montel. Application of SSCP-PCR fingerprinting to profile the yeast community in raw milk Salers cheeses // Systematic and Applied Microbiology. 2006. Vol. 29(2). P. 172–180.
7. K. Gori, M. Ryssel, N. Arneborg, L. Jespersen. Isolation and identification of the microbiota of Danish farmhouse and industrially produced surface- ripened cheeses // Microbial Ecology. 2013.Vol.65(3).P. 602–615.
8. Пантелеев С. В. Молекулярно- генетическая диагностика и идентификация возбудителей микозов посадочного материала древесных видов в лесных питомниках Беларуси: автореф. дис. … канд. биол. наук: 06.03.01. – Гомель, 2013.
9. Forest Pathology. Diseases of forest and shade trees // http://www.forestpathology.org/index.html.
10. Падутов В. Е., Баранов О. Ю., Воропаев Е. В. Методы молекулярно-генетического анализа. – Минск, 2007.
Рецензия
Для цитирования:
Падутов В. Метагеномный анализ грибных фитопатогенов посадочного материала берез. Наука и инновации. 2022;(3):66-70. https://doi.org/10.29235/1818-9857-2022-3-66-70
For citation:
Padutov V. Metagenomic analysis of fungal phytopathogens in birch planting material. Science and Innovations. 2022;(3):66-70. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1818-9857-2022-3-66-70
Просмотров: 163
Послать статью по эл. почте 