innosferaНаука и инновацииScience and Innovations1818-98572412-9372Издательский дом «Белорусская наука»10.29235/1818-9857-2023-1-79-84innosfera-378Research ArticleДИССЕРТАЦИОННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯDISSERTATION RESEARCHЭффективность метода мультиплексной ПЦР в реальном времени при определении коротких изоформ гена IKZF1 (Ikaros)Efficacy of real-time multiplex PCR method for detecting short isoforms of IKZF1 (Ikaros) geneБогатенковаД.BogatenkovaDaria

Дарья Богатенкова, младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований 

yanchenko.darya255@gmail.comВшивковаО.VshivkovaOlga

Ольга Вшивкова, старший научный сотрудник лаборатории клинических исследований 

vshyukova@gmail.comМелешкоА.MeleshkoAlexander

Александр Мелешко, ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук

meleshko@tut.byРНПЦ детской онкологии, гематологии и иммунологииBelarus202331012023117984Copyright © Издательский дом «Белорусская наука», 20232023Издательский дом «Белорусская наука»Издательский дом «Белорусская наука»https://innosfera.belnauka.by/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://innosfera.belnauka.by/jour/article/view/378

Внутригенные делеции в гене IKZF1– одна из наиболее значимых генетических аберраций при прогнозировании рецидивов В-клеточного острого лимфобластного лейкоза (В-ОЛЛ). Диагностика делеций IKZF1, особенно редких типов, осложняется разнообразием точек разрыва ДНК, необходимостью подбора ПЦР-праймеров для каждой из них, реже – пациент-специфических праймеров для подтверждения делеции и точек разрыва методом секвенирования по Сенгеру. В связи с этим определение коротких транскриптов (изоформ), которые всегда формируются в результате делеции функционального участка гена IKZF1, является альтернативным методом оценки статуса данного гена в рутинной лабораторной практике. Статья посвящена разработке быстрого, выполняемого в течение одного рабочего дня, метода мультиплексной ПЦР в реальном времени, позволяющего выявлять экспрессию 3 прогностически значимых транскриптов в одной реакции, и оценке его эффективности. Диагностическая чувствительность метода составила 90,14%, а специфичность – 89,47%.

The article deals with the development of a rapid method for predicting recurrence of B-cell acute lymphoblastic leukemia by multiplex real-time PCR, which allows detecting the expression of 3 prognostically significant transcripts in a single reaction.

IKZF1Ikarosострый лимфобластный лейкозмультиплексная ПЦРIKZF1Ikarosacute lymphoblastic leukemiamultiplex real-time PCRReferencesVairy S., Tran T.H. (2020). IKZF1 alterations in acute lymphoblastic leukemia: the good, the bad and the ugly. Blood Reviews // https://doi.org/10.1016/j.blre.2020.100677.Vairy S., Tran T.H. (2020). IKZF1 alterations in acute lymphoblastic leukemia: the good, the bad and the ugly. Blood Reviews // https://doi.org/10.1016/j.blre.2020.100677.Mullighan C.G., DowningJ.R. (2009) Global genomic characterization of acute lymphoblastic leukemia. Semin Hematol. Vol. 46, N.1. PP. 3–15.Mullighan C.G., DowningJ.R. (2009) Global genomic characterization of acute lymphoblastic leukemia. Semin Hematol. Vol. 46, N.1. PP. 3–15.Роль транскрипционного фактора Ikaros в нормальном гемопоэзе и лейкозогенезе: биологические и клинические аспекты / О.С. Вшивкова, А.Н.Мелешко// Успехи молекулярной онкологии. 2015. №1. Т.2. С.13–16.Роль транскрипционного фактора Ikaros в нормальном гемопоэзе и лейкозогенезе: биологические и клинические аспекты / О.С. Вшивкова, А.Н.Мелешко// Успехи молекулярной онкологии. 2015. №1. Т.2. С.13–16.Expression of aberrantly spliced oncogenic Ikaros isoforms coupled with clonal IKZF1 deletions and chimeric oncogenes in acute lymphoblastic leukemia/ V. Vshyukova, A. Valochnik, A. Meleshko// Blood Cells Mol Dis. 2018. Vol. 71. P.29–38.Expression of aberrantly spliced oncogenic Ikaros isoforms coupled with clonal IKZF1 deletions and chimeric oncogenes in acute lymphoblastic leukemia/ V. Vshyukova, A. Valochnik, A. Meleshko// Blood Cells Mol Dis. 2018. Vol. 71. P.29–38.Прогностическое значение аберраций гена IKZF1 у пациентов с B-клеточным острым лимфобластным лейкозом / Вшивкова О.С., Мелешко А.Н. // Достижения белорусской науки, вып. XXIII.– Минск, 2019.Прогностическое значение аберраций гена IKZF1 у пациентов с B-клеточным острым лимфобластным лейкозом / Вшивкова О.С., Мелешко А.Н. // Достижения белорусской науки, вып. XXIII.– Минск, 2019.Внутригенные делеции в локусе IKZF1 при остром лимфобластном лейкозе у детей / А.Н.Мелешко, О.С. Вшивкова// Лабораторная диагностика. Восточная Европа. 2014. №4 (12). С.57–65.Внутригенные делеции в локусе IKZF1 при остром лимфобластном лейкозе у детей / А.Н.Мелешко, О.С. Вшивкова// Лабораторная диагностика. Восточная Европа. 2014. №4 (12). С.57–65.Достижения в терапии острого лимфобластного лейкоза у молодых взрослых Республики Беларусь/ Н.В. Мигаль, О.И. Быданов, А.С. Лелей, Е.А.Столярова, Л.В. Мовчан, Е.В. Волочник, О.С. Вшивкова, В.В. Дмитриев, И.В. Тарасевич, Н.Ф.Казакевич, Л.В. Артюшкевич, М.В. Белевцев, О.В. Алейникова// Гематология и трансфузиология. Восточная Европа. 2017. №3. Т.3. С.352–364.Достижения в терапии острого лимфобластного лейкоза у молодых взрослых Республики Беларусь/ Н.В. Мигаль, О.И. Быданов, А.С. Лелей, Е.А.Столярова, Л.В. Мовчан, Е.В. Волочник, О.С. Вшивкова, В.В. Дмитриев, И.В. Тарасевич, Н.Ф.Казакевич, Л.В. Артюшкевич, М.В. Белевцев, О.В. Алейникова// Гематология и трансфузиология. Восточная Европа. 2017. №3. Т.3. С.352–364.Инструкция производителя по использованию TRI Reagent®// https://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/protocols/biology/tri-reagent.html.Инструкция производителя по использованию TRI Reagent®// https://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/protocols/biology/tri-reagent.html.Методы определения аберраций гена IKZF1 для диагностики острого лимфобластного лейкоза/ Мелешко А.Н., Прохореня И.В.– Минск, 2013.Методы определения аберраций гена IKZF1 для диагностики острого лимфобластного лейкоза/ Мелешко А.Н., Прохореня И.В.– Минск, 2013.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.